O Paciente deita confortavelmente, de lado, em uma maca. O médico introduz o endoscópio, nome técnico do tubo flexível que contem uma pequena camera em sua extremidade. Durante o procedimento, um objeto plástico é colocado na boca para mantê-la aberta e facilitar o manuseio do endoscópio pelo especialista.
Para o diagnóstico de muitas doenças que acometem direta ou indiretamente essa região. Entre as principais, estão refluxo, gastrite, úlceras, pólipos, doenças infecciosas e câncer em estágio inicial e avançado.